Estructura secundaria
El término “estructura secundaria” se refiere
a la estructura que adopta espacialmente una parte del polipéptido. Ocurre
cuando los hidrógenos de la secuencia interactúan mediante puentes de hidrógeno.
Puente de hidrógeno: se comparte un protón
entre dos moléculas, formando un enlace débil.
Dos tipos de estructuras son particularmente
estables y frecuentes en las proteínas: la hélice α y la lámina β
Hélice α: la cadena adopta una estructura
helicoidal, que se mantiene mediante puentes de hidrógeno, con los grupos R
orientados hacia el exterior. Para formar esta estructura, el grupo carboxilo
de cada aminoácido (n) se une mediante un puente de hidrógeno al grupo amino de
otro aminoácido (n+4). Es una estructura estable porque da lugar a un máximo
número de interacciones.
Hélice α
Conformación β: la cadena queda estirada y la
estructura se dispone espacialmente en zigzag formando láminas (hojas plegadas
β). La disposición puede ser paralela o antiparalela. Puede darse entre
regiones próximas o distantes del polipéptido. Los grupos R sobresalen de la
lámina en ambos sentidos, de forma alterna. La conformación β se estabiliza
mediante puentes de hidrógeno, como en el caso anterior.
Láminas β: antiparalela y
paralela
En las láminas β los giros se forman por la
unión mediante un puente de hidrógeno del aminoácido n y el n+3.
Estructura del giro en una lámina β
Al representar la estructura de una proteína,
si se desea resaltar su estructura secundaria, las hélices alfa se representan
como cintas en espiral, las láminas beta como cintas en flecha y las regiones
con otro tipo de estructura como líneas finas (“random coil”).
No hay comentarios.:
Publicar un comentario